Балыкчинский колледж при Кыргызском государственном университете строительства, транспорта и архитектуры имени Н.Исанова был создан на основании приказа Министерства образования и науки Кыргызской Республики от 27 сентября 2006 года, приказ №609/1 на базе Балыкчинского филиала КГУСТА.
Указом президента Кыргызской Республики № 243 от 18 июля 2022 года Кыргызский государственный университет строительства, транспорта и архитектуры имени Н.Исанова реорганизован путем присоединения к Кыргызскому государственному техническому университету имени И.Раззакова.
Балыкчинский колледж при КГТУ имени И. Раззакова ведет образовательную деятельность в сфере среднего общего и среднего профессионального образования на основании лицензии LC150000725, выданный решением Совета по лицензированию Министерства образования и науки Кыргызской Республики протокол № 1-13-4 от 08.09.2015 года, регистрационный номер 15/0449 и согласно Уставу зарегистрированный Иссык-Кульским областным Управлением юстиции №0049332 от 18 октября 2022 года.