Инженеров-строителей в Кыргызстане начали подготавливать в 1953 г. при Кыргызском государственном университете (КГУ). В 1954 г. был образован Фрунзенский политехнический институт (ФПИ), в том же году в составе которого был открыт строительный факультет по подготовке инженеров-строителей по специальности: Промышленное и гражданское строительство (ПГС), первым деканом которого стал известный в республике инженер-строитель П.Н. Проворов, вслед за которым в разное время строительный факультет возглавляли: Б.Е. Пак, В.И. Трулев, М.Ш. Тулемышев, В.Н. Зенин, Т.А. Аманкулов,
На строительном факультете ФПИ впервые в Республике и в Средней Азии была создана Проблемная научно-исследовательская лаборатория сейсмостойкого строительства (1966 г.), в чем огромны заслуги М.М. Сердюкова, А.М. Медетбекова, Б.Е. Пака, Ю.А. Коваля, В.П. Чуднецова, М.Ш. Тулемышева, А.С. Тян, Л.Л. Солдатовой, Н.А. Руденко и др..
В 1992 году на базе строительного факультета, инженерно-строительного и архитектурного факультетов ФПИ был образован Кыргызский архитектурно-строительный институт (КАСИ). В 1998 году Указом Президента КР КАСИ преобразован в Кыргызский государственный университет строительства, транспорта и архитектуры (КГУСТА). Деканами строительного факультета были И.Г. Савелов, К.Т. Темикеев.
Для повышения качества подготовки выпускников по направлению «Строительство» и повышению уровня учебно-воспитательного процесса приказом ректора «1/221 от 27.09.2006г. создан при Институте строительства, экономики и менеджмента (ИСЭМ) строительно-технологический факультет (СТФ), деканом которого был назначен к.т.н. доцент Ж.А. Абдраимов, а директором ИСЭМ к.т.н. профессор К.Т. Темикеев.
В рамках реализации «Концепции оптимизации структурных преобразований университета на 2016-2017 гг. в свете реализации Стратегии образования в Кыргызской Республики до 2020 г.» приказом ректора 1/121 от 30.08.2017 г. на базе строительно-технологического факультета образован Институт строительства и коммуникаций (ИСиТ), директором которого назначен к.ф-м.н. доцент Ж.Ы. Маматов, заместителем директора по учебной работе к.н.т. доцент К.Т. Саткыналиев, заместителем директора по воспитательной работе Эргешбай уулу А.
Во исполнение Указа Президента Кыргызской Республики УП №243 от 18.07.2022 г. «О мерах по повышению потенциала и конкурентоспособности образовательных организаций высшего профессионального образования Кыргызской Республики» и Постановления Кабинета Министров Кыргызской Республики №414 от 29.07.2022 г. “О некоторых вопросах реорганизации высших учебных заведений Кыргызской Республики” в связи реорганизацией учреждения “Кыргызский государственный технический университет им. И. Раззакова” путем присоединения к нему учреждения “Кыргызский государственный университет строительства, транспорта и архитектуры им. Н. Исанова” и учреждения “Кыргызский государственный университет геологии, горного дела и освоения природных ресурсов им. академика У. Асаналиева
Приказом ректора 1/135 от 01.09.2022 г. на базе Институт строительства и коммуникаций (ИСиТ), образован Кыргызский инженерно-строительный институт им. Н. Исанова (КИСИ) и приказом 3/217 от 01.09.22 г. назначен директор к.ф-м.н. доцент Ж.Ы. Маматов, заместителем директора по учебной работе к.н.т., доцент М. К. Жылкычиев, заместителем директора по воспитательной работе Эргешбай уулу А.